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Tool Stacks

×Nouveau dashboard Special-VM GPU/BigMem/ManyCores :Un nouveau tableau de bord permet de connaitre la disponibilité des gabarits spéciaux GPU, BigMem et ManyCores sur les sites Biosphères (Menu "Support -> Usage Special-VM"). Nous vous invitons à le consulter avant de déployer une VM avec un de ces gabarits spéciaux.
×Support Biosphère réduit du 2 au 29 août 2026 :Pendant cette période, le support aux utilisateurs est réduit pour les services communs de la fédération cloud IFB-Biosphère et certains sites cloud. Il n'y aura pas de validation des nouveaux comptes, projets et formations pendant cette période. En cas de problème avec une VM, vous pouvez contacter directement les administrateurs des sites cloud correspondants. Les adresses mails de contact sont affichées sur la page d'état du système [https://biosphere.france-bioinformatique.fr/cloud/system_status].
Details
NameStacks
Version1.37
DescriptionStacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Homepage http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/
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