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Tool SPAdes

×Nouveau dashboard Special-VM GPU/BigMem/ManyCores :Un nouveau tableau de bord permet de connaitre la disponibilité des gabarits spéciaux GPU, BigMem et ManyCores sur les sites Biosphères (Menu "Support -> Usage Special-VM"). Nous vous invitons à le consulter avant de déployer une VM avec un de ces gabarits spéciaux.
×Support Biosphère réduit du 2 au 29 août 2026 :Pendant cette période, le support aux utilisateurs est réduit pour les services communs de la fédération cloud IFB-Biosphère et certains sites cloud. Il n'y aura pas de validation des nouveaux comptes, projets et formations pendant cette période. En cas de problème avec une VM, vous pouvez contacter directement les administrateurs des sites cloud correspondants. Les adresses mails de contact sont affichées sur la page d'état du système [https://biosphere.france-bioinformatique.fr/cloud/system_status].
Details
NameSPAdes
Version
DescriptionSt. Petersburg genome assembler – is intended for both standard isolates and single-cell MDA bacteria assemblies. SPAdes 3.9 works with Illumina or IonTorrent reads and is capable of providing hybrid assemblies using PacBio, Oxford Nanopore and Sanger reads. Additional contigs can be provided and can be used as long reads.
bio.tools https://bio.tools/Spades
Homepage http://cab.spbu.ru/software/spades/
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