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Tool dDocent

×Nouveau dashboard Special-VM GPU/BigMem/ManyCores :Un nouveau tableau de bord permet de connaitre la disponibilité des gabarits spéciaux GPU, BigMem et ManyCores sur les sites Biosphères (Menu "Support -> Usage Special-VM"). Nous vous invitons à le consulter avant de déployer une VM avec un de ces gabarits spéciaux.
×Support Biosphère réduit du 2 au 29 août 2026 :Pendant cette période, le support aux utilisateurs est réduit pour les services communs de la fédération cloud IFB-Biosphère et certains sites cloud. Il n'y aura pas de validation des nouveaux comptes, projets et formations pendant cette période. En cas de problème avec une VM, vous pouvez contacter directement les administrateurs des sites cloud correspondants. Les adresses mails de contact sont affichées sur la page d'état du système [https://biosphere.france-bioinformatique.fr/cloud/system_status].
Details
NamedDocent
Version2.18
DescriptiondDocent is simple bash wrapper to QC, assemble, map, and call SNPs from almost any kind of RAD sequencing. If you have a reference already, dDocent can be used to call SNPs from almost any type of NGS data set. It is designed to run on Linux based machines with large memory capacity and multiple processing cores, and it can be modified for use on HPC.
Homepage https://github.com/jpuritz/dDocent
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