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EDAM Topic: Metagenomic sequencing

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×Nouveau dashboard Special-VM GPU/BigMem/ManyCores :Un nouveau tableau de bord permet de connaitre la disponibilité des gabarits spéciaux GPU, BigMem et ManyCores sur les sites Biosphères (Menu "Support -> Usage Special-VM"). Nous vous invitons à le consulter avant de déployer une VM avec un de ces gabarits spéciaux.
×Support Biosphère réduit du 2 au 29 août 2026 :Pendant cette période, le support aux utilisateurs est réduit pour les services communs de la fédération cloud IFB-Biosphère et certains sites cloud. Il n'y aura pas de validation des nouveaux comptes, projets et formations pendant cette période. En cas de problème avec une VM, vous pouvez contacter directement les administrateurs des sites cloud correspondants. Les adresses mails de contact sont affichées sur la page d'état du système [https://biosphere.france-bioinformatique.fr/cloud/system_status].
Details
FamilyTopic
LabelMetagenomic sequencing
Parent Sequencing
DefinitionApproach which samples, in parallel, all genes in all organisms present in a given sample, e.g. to provide insight into biodiversity and function.
Exact synonyms
  • Shotgun metagenomic sequencing
Narrow synonyms 
    bio.toolshttp://edamontology.org/topic_3837
    Appliances
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    • MetaBAT 2
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